Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim43cP86449 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim43cP86449 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim43cP86449 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim43cP86449 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43cP86449 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms