Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gbx1P82976 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gbx1P82976 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbx1P82976 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbx1P82976 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbx1P82976 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms