Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptprn2P80560 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptprn2P80560 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptprn2P80560 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptprn2P80560 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms