Protein–RNA interactions for Protein: P70460

Vasp, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VaspP70460 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VaspP70460 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VaspP70460 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VaspP70460 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VaspP70460 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VaspP70460 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VaspP70460 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VaspP70460 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VaspP70460 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VaspP70460 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VaspP70460 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VaspP70460 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VaspP70460 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VaspP70460 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VaspP70460 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VaspP70460 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VaspP70460 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VaspP70460 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VaspP70460 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VaspP70460 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VaspP70460 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VaspP70460 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VaspP70460 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VaspP70460 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VaspP70460 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VaspP70460 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VaspP70460 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VaspP70460 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VaspP70460 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VaspP70460 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VaspP70460 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VaspP70460 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VaspP70460 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VaspP70460 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VaspP70460 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VaspP70460 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VaspP70460 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VaspP70460 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VaspP70460 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VaspP70460 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VaspP70460 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VaspP70460 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VaspP70460 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VaspP70460 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VaspP70460 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VaspP70460 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VaspP70460 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VaspP70460 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VaspP70460 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VaspP70460 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VaspP70460 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VaspP70460 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VaspP70460 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VaspP70460 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VaspP70460 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VaspP70460 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VaspP70460 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VaspP70460 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VaspP70460 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VaspP70460 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VaspP70460 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VaspP70460 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VaspP70460 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VaspP70460 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VaspP70460 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VaspP70460 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VaspP70460 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VaspP70460 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VaspP70460 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VaspP70460 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VaspP70460 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VaspP70460 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VaspP70460 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VaspP70460 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VaspP70460 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VaspP70460 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VaspP70460 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VaspP70460 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VaspP70460 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VaspP70460 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VaspP70460 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VaspP70460 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VaspP70460 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VaspP70460 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VaspP70460 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VaspP70460 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VaspP70460 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VaspP70460 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VaspP70460 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VaspP70460 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VaspP70460 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VaspP70460 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VaspP70460 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VaspP70460 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VaspP70460 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VaspP70460 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VaspP70460 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VaspP70460 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VaspP70460 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VaspP70460 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms