Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SeboxP70368 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SeboxP70368 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SeboxP70368 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SeboxP70368 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeboxP70368 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SeboxP70368 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeboxP70368 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeboxP70368 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SeboxP70368 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SeboxP70368 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SeboxP70368 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SeboxP70368 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SeboxP70368 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms