Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msx3P70354 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msx3P70354 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Msx3P70354 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msx3P70354 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Msx3P70354 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx3P70354 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx3P70354 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msx3P70354 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msx3P70354 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msx3P70354 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msx3P70354 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msx3P70354 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msx3P70354 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Msx3P70354 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msx3P70354 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msx3P70354 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msx3P70354 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msx3P70354 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms