Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aup1P70295 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aup1P70295 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aup1P70295 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aup1P70295 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Aup1P70295 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aup1P70295 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aup1P70295 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aup1P70295 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aup1P70295 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Aup1P70295 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aup1P70295 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aup1P70295 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Aup1P70295 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aup1P70295 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aup1P70295 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aup1P70295 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aup1P70295 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Aup1P70295 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Aup1P70295 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms