Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprvP70289 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprvP70289 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprvP70289 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprvP70289 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprvP70289 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprvP70289 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprvP70289 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprvP70289 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprvP70289 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprvP70289 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PtprvP70289 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms