Protein–RNA interactions for Protein: P63280

Ube2i, SUMO-conjugating enzyme UBC9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2iP63280 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2iP63280 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2iP63280 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2iP63280 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2iP63280 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2iP63280 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2iP63280 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2iP63280 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube2iP63280 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2iP63280 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2iP63280 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube2iP63280 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube2iP63280 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1292.2 ms