Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Crip1P63254 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Crip1P63254 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Crip1P63254 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Crip1P63254 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Crip1P63254 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Crip1P63254 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Crip1P63254 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip1P63254 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Crip1P63254 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Crip1P63254 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Crip1P63254 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Crip1P63254 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Crip1P63254 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Crip1P63254 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip1P63254 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crip1P63254 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crip1P63254 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crip1P63254 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms