Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sumo1P63166 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sumo1P63166 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sumo1P63166 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms