Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtnP63089 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtnP63089 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtnP63089 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtnP63089 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtnP63089 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtnP63089 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtnP63089 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtnP63089 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtnP63089 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtnP63089 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtnP63089 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtnP63089 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtnP63089 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtnP63089 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtnP63089 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtnP63089 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtnP63089 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtnP63089 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtnP63089 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtnP63089 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtnP63089 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtnP63089 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtnP63089 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtnP63089 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtnP63089 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtnP63089 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtnP63089 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtnP63089 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtnP63089 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtnP63089 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtnP63089 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtnP63089 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtnP63089 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtnP63089 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtnP63089 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtnP63089 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtnP63089 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtnP63089 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtnP63089 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtnP63089 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtnP63089 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtnP63089 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtnP63089 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtnP63089 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtnP63089 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtnP63089 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtnP63089 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtnP63089 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtnP63089 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtnP63089 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtnP63089 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtnP63089 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtnP63089 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtnP63089 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtnP63089 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtnP63089 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtnP63089 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtnP63089 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtnP63089 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtnP63089 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtnP63089 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtnP63089 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtnP63089 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtnP63089 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtnP63089 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtnP63089 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtnP63089 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtnP63089 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtnP63089 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtnP63089 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtnP63089 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtnP63089 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtnP63089 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtnP63089 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtnP63089 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtnP63089 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtnP63089 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PtnP63089 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtnP63089 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtnP63089 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtnP63089 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtnP63089 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtnP63089 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtnP63089 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtnP63089 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PtnP63089 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtnP63089 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtnP63089 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtnP63089 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtnP63089 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms