Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps27aP62983 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps27aP62983 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps27aP62983 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps27aP62983 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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