Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ElobP62869 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ElobP62869 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ElobP62869 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ElobP62869 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ElobP62869 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ElobP62869 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ElobP62869 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ElobP62869 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ElobP62869 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ElobP62869 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ElobP62869 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ElobP62869 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ElobP62869 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ElobP62869 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ElobP62869 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ElobP62869 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ElobP62869 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ElobP62869 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ElobP62869 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ElobP62869 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ElobP62869 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ElobP62869 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ElobP62869 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ElobP62869 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ElobP62869 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ElobP62869 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ElobP62869 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ElobP62869 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ElobP62869 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ElobP62869 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ElobP62869 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ElobP62869 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ElobP62869 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ElobP62869 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ElobP62869 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ElobP62869 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ElobP62869 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ElobP62869 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ElobP62869 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ElobP62869 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ElobP62869 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ElobP62869 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ElobP62869 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ElobP62869 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ElobP62869 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ElobP62869 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ElobP62869 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ElobP62869 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ElobP62869 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ElobP62869 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ElobP62869 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ElobP62869 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ElobP62869 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ElobP62869 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ElobP62869 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ElobP62869 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ElobP62869 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ElobP62869 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ElobP62869 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ElobP62869 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ElobP62869 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ElobP62869 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ElobP62869 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ElobP62869 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ElobP62869 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ElobP62869 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ElobP62869 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ElobP62869 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ElobP62869 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ElobP62869 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ElobP62869 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ElobP62869 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ElobP62869 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ElobP62869 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ElobP62869 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ElobP62869 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ElobP62869 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ElobP62869 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ElobP62869 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ElobP62869 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ElobP62869 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ElobP62869 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ElobP62869 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ElobP62869 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ElobP62869 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ElobP62869 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ElobP62869 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ElobP62869 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ElobP62869 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ElobP62869 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ElobP62869 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ElobP62869 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ElobP62869 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ElobP62869 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ElobP62869 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ElobP62869 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ElobP62869 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ElobP62869 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ElobP62869 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms