Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhobP62746 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhobP62746 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RhobP62746 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhobP62746 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhobP62746 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RhobP62746 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RhobP62746 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RhobP62746 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RhobP62746 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhobP62746 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhobP62746 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhobP62746 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhobP62746 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RhobP62746 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhobP62746 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhobP62746 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhobP62746 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RhobP62746 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RhobP62746 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhobP62746 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhobP62746 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhobP62746 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhobP62746 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RhobP62746 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RhobP62746 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhobP62746 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhobP62746 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhobP62746 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RhobP62746 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhobP62746 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhobP62746 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhobP62746 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhobP62746 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RhobP62746 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhobP62746 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhobP62746 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhobP62746 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhobP62746 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhobP62746 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhobP62746 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhobP62746 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhobP62746 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhobP62746 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhobP62746 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhobP62746 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhobP62746 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhobP62746 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhobP62746 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhobP62746 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhobP62746 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhobP62746 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhobP62746 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhobP62746 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhobP62746 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhobP62746 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhobP62746 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhobP62746 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhobP62746 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhobP62746 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhobP62746 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhobP62746 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhobP62746 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhobP62746 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhobP62746 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhobP62746 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhobP62746 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhobP62746 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhobP62746 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhobP62746 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhobP62746 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhobP62746 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhobP62746 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhobP62746 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhobP62746 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhobP62746 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhobP62746 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhobP62746 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhobP62746 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhobP62746 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhobP62746 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhobP62746 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhobP62746 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhobP62746 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhobP62746 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhobP62746 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhobP62746 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhobP62746 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RhobP62746 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RhobP62746 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms