Protein–RNA interactions for Protein: P61202

Cops2, COP9 signalosome complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops2P61202 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops2P61202 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cops2P61202 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cops2P61202 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops2P61202 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops2P61202 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops2P61202 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops2P61202 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops2P61202 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops2P61202 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops2P61202 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops2P61202 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops2P61202 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cops2P61202 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cops2P61202 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops2P61202 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cops2P61202 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cops2P61202 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1094.2 ms