Protein–RNA interactions for Protein: P59481

Lman2l, VIP36-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman2lP59481 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lman2lP59481 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lman2lP59481 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lman2lP59481 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lman2lP59481 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lman2lP59481 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lman2lP59481 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms