Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdrg1P59048 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdrg1P59048 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdrg1P59048 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdrg1P59048 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdrg1P59048 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms