Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ripk2P58801 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk2P58801 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk2P58801 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ripk2P58801 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms