Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Paxbp1P58501 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Paxbp1P58501 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Paxbp1P58501 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Paxbp1P58501 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Paxbp1P58501 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms