Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdsp1P58466 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdsp1P58466 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdsp1P58466 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms