Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn4P57780 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn4P57780 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn4P57780 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Actn4P57780 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn4P57780 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn4P57780 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Actn4P57780 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Actn4P57780 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Actn4P57780 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Actn4P57780 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn4P57780 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn4P57780 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Actn4P57780 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn4P57780 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn4P57780 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn4P57780 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn4P57780 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn4P57780 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Actn4P57780 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn4P57780 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn4P57780 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms