Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp5P56399 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp5P56399 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Usp5P56399 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp5P56399 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp5P56399 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp5P56399 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp5P56399 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp5P56399 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp5P56399 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp5P56399 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp5P56399 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp5P56399 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms