Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cox17P56394 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox17P56394 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cox17P56394 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox17P56394 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox17P56394 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox17P56394 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox17P56394 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox17P56394 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox17P56394 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox17P56394 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox17P56394 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox17P56394 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox17P56394 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox17P56394 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox17P56394 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cox17P56394 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox17P56394 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cox17P56394 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.6 ms