Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PltpP55065 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PltpP55065 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PltpP55065 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PltpP55065 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PltpP55065 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PltpP55065 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PltpP55065 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PltpP55065 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PltpP55065 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PltpP55065 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PltpP55065 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PltpP55065 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PltpP55065 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PltpP55065 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PltpP55065 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PltpP55065 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PltpP55065 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PltpP55065 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PltpP55065 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PltpP55065 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PltpP55065 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PltpP55065 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PltpP55065 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PltpP55065 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PltpP55065 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PltpP55065 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PltpP55065 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PltpP55065 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PltpP55065 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PltpP55065 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PltpP55065 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PltpP55065 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PltpP55065 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PltpP55065 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PltpP55065 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PltpP55065 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PltpP55065 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PltpP55065 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PltpP55065 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PltpP55065 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PltpP55065 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PltpP55065 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PltpP55065 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PltpP55065 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PltpP55065 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PltpP55065 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PltpP55065 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PltpP55065 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PltpP55065 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PltpP55065 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PltpP55065 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PltpP55065 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PltpP55065 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PltpP55065 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PltpP55065 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PltpP55065 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PltpP55065 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PltpP55065 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PltpP55065 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PltpP55065 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PltpP55065 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PltpP55065 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PltpP55065 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PltpP55065 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PltpP55065 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PltpP55065 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PltpP55065 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PltpP55065 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PltpP55065 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PltpP55065 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PltpP55065 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PltpP55065 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PltpP55065 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PltpP55065 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PltpP55065 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PltpP55065 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PltpP55065 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PltpP55065 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PltpP55065 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PltpP55065 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PltpP55065 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PltpP55065 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PltpP55065 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PltpP55065 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PltpP55065 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PltpP55065 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PltpP55065 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PltpP55065 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PltpP55065 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PltpP55065 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PltpP55065 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PltpP55065 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PltpP55065 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PltpP55065 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PltpP55065 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PltpP55065 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PltpP55065 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PltpP55065 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PltpP55065 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms