Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc12a1P55014 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc12a1P55014 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc12a1P55014 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc12a1P55014 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms