Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NrlP54846 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NrlP54846 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NrlP54846 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NrlP54846 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NrlP54846 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NrlP54846 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NrlP54846 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NrlP54846 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NrlP54846 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NrlP54846 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NrlP54846 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NrlP54846 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NrlP54846 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NrlP54846 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NrlP54846 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NrlP54846 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NrlP54846 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NrlP54846 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NrlP54846 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NrlP54846 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NrlP54846 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NrlP54846 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NrlP54846 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NrlP54846 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NrlP54846 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NrlP54846 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NrlP54846 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NrlP54846 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NrlP54846 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NrlP54846 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NrlP54846 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NrlP54846 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NrlP54846 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NrlP54846 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NrlP54846 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NrlP54846 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NrlP54846 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NrlP54846 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NrlP54846 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NrlP54846 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NrlP54846 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NrlP54846 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NrlP54846 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NrlP54846 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NrlP54846 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NrlP54846 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NrlP54846 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NrlP54846 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NrlP54846 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NrlP54846 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NrlP54846 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NrlP54846 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NrlP54846 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NrlP54846 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrlP54846 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrlP54846 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrlP54846 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrlP54846 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NrlP54846 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrlP54846 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrlP54846 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrlP54846 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NrlP54846 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrlP54846 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrlP54846 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrlP54846 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NrlP54846 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrlP54846 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrlP54846 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrlP54846 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrlP54846 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NrlP54846 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrlP54846 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NrlP54846 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NrlP54846 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NrlP54846 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NrlP54846 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrlP54846 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrlP54846 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NrlP54846 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrlP54846 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrlP54846 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NrlP54846 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrlP54846 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrlP54846 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrlP54846 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrlP54846 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrlP54846 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NrlP54846 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrlP54846 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrlP54846 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrlP54846 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NrlP54846 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NrlP54846 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NrlP54846 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NrlP54846 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NrlP54846 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NrlP54846 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NrlP54846 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms