Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dbx1P52950 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dbx1P52950 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dbx1P52950 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dbx1P52950 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dbx1P52950 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dbx1P52950 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dbx1P52950 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dbx1P52950 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dbx1P52950 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dbx1P52950 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dbx1P52950 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dbx1P52950 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dbx1P52950 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dbx1P52950 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms