Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr4P51680 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr4P51680 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr4P51680 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr4P51680 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr4P51680 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr4P51680 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr4P51680 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr4P51680 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr4P51680 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr4P51680 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr4P51680 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr4P51680 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr4P51680 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr4P51680 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr4P51680 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr4P51680 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr4P51680 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr4P51680 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr4P51680 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr4P51680 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr4P51680 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr4P51680 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr4P51680 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr4P51680 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr4P51680 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr4P51680 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr4P51680 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr4P51680 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr4P51680 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr4P51680 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr4P51680 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccr4P51680 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr4P51680 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr4P51680 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr4P51680 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms