Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TubP50586 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TubP50586 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TubP50586 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TubP50586 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TubP50586 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TubP50586 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TubP50586 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TubP50586 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TubP50586 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TubP50586 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TubP50586 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TubP50586 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TubP50586 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TubP50586 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TubP50586 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TubP50586 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TubP50586 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TubP50586 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TubP50586 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TubP50586 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TubP50586 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TubP50586 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TubP50586 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TubP50586 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TubP50586 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TubP50586 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TubP50586 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TubP50586 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TubP50586 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TubP50586 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TubP50586 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TubP50586 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TubP50586 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TubP50586 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TubP50586 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TubP50586 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TubP50586 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TubP50586 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TubP50586 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TubP50586 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TubP50586 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TubP50586 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TubP50586 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TubP50586 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TubP50586 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TubP50586 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TubP50586 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TubP50586 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TubP50586 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TubP50586 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TubP50586 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TubP50586 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TubP50586 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TubP50586 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TubP50586 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TubP50586 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TubP50586 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TubP50586 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TubP50586 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TubP50586 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TubP50586 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TubP50586 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TubP50586 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TubP50586 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TubP50586 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TubP50586 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TubP50586 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TubP50586 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TubP50586 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TubP50586 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TubP50586 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TubP50586 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TubP50586 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TubP50586 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TubP50586 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TubP50586 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TubP50586 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TubP50586 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TubP50586 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TubP50586 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TubP50586 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TubP50586 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TubP50586 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TubP50586 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TubP50586 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TubP50586 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TubP50586 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TubP50586 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TubP50586 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TubP50586 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TubP50586 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TubP50586 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TubP50586 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TubP50586 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TubP50586 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TubP50586 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TubP50586 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TubP50586 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TubP50586 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms