Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtpreP49446 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtpreP49446 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtpreP49446 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpreP49446 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpreP49446 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtpreP49446 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtpreP49446 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PtpreP49446 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtpreP49446 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtpreP49446 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtpreP49446 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtpreP49446 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtpreP49446 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpreP49446 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtpreP49446 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtpreP49446 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtpreP49446 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpreP49446 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpreP49446 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtpreP49446 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms