Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CitP49025 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CitP49025 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CitP49025 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CitP49025 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CitP49025 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CitP49025 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CitP49025 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CitP49025 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CitP49025 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CitP49025 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CitP49025 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CitP49025 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CitP49025 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CitP49025 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CitP49025 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CitP49025 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CitP49025 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CitP49025 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CitP49025 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CitP49025 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CitP49025 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CitP49025 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CitP49025 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CitP49025 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CitP49025 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CitP49025 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CitP49025 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CitP49025 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CitP49025 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CitP49025 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CitP49025 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CitP49025 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CitP49025 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CitP49025 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CitP49025 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CitP49025 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CitP49025 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CitP49025 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CitP49025 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CitP49025 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CitP49025 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CitP49025 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CitP49025 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CitP49025 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CitP49025 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CitP49025 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CitP49025 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CitP49025 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CitP49025 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CitP49025 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CitP49025 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CitP49025 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CitP49025 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CitP49025 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CitP49025 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CitP49025 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CitP49025 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CitP49025 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CitP49025 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CitP49025 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CitP49025 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CitP49025 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CitP49025 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CitP49025 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CitP49025 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CitP49025 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CitP49025 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CitP49025 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CitP49025 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CitP49025 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CitP49025 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CitP49025 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CitP49025 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CitP49025 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CitP49025 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CitP49025 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CitP49025 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CitP49025 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CitP49025 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CitP49025 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CitP49025 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CitP49025 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CitP49025 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CitP49025 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CitP49025 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CitP49025 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CitP49025 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CitP49025 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CitP49025 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CitP49025 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CitP49025 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CitP49025 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CitP49025 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CitP49025 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CitP49025 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CitP49025 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CitP49025 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CitP49025 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CitP49025 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms