Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnni3P48787 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnni3P48787 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnni3P48787 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnni3P48787 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms