Protein–RNA interactions for Protein: P47801

Emp1, Epithelial membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp1P47801 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emp1P47801 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emp1P47801 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emp1P47801 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Emp1P47801 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Emp1P47801 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emp1P47801 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emp1P47801 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emp1P47801 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emp1P47801 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emp1P47801 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Emp1P47801 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emp1P47801 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emp1P47801 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emp1P47801 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Emp1P47801 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms