Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11bP46638 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11bP46638 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11bP46638 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11bP46638 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms