Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad52P43352 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad52P43352 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad52P43352 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rad52P43352 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad52P43352 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad52P43352 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad52P43352 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad52P43352 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad52P43352 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad52P43352 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad52P43352 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad52P43352 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad52P43352 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad52P43352 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad52P43352 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms