Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gdf6P43028 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdf6P43028 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdf6P43028 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdf6P43028 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gdf6P43028 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf6P43028 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gdf6P43028 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf6P43028 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms