Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd9P40240 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd9P40240 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd9P40240 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd9P40240 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd9P40240 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd9P40240 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd9P40240 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd9P40240 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd9P40240 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd9P40240 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd9P40240 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd9P40240 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd9P40240 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd9P40240 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd9P40240 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd9P40240 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd9P40240 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms