Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Flt1P35969 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Flt1P35969 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Flt1P35969 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Flt1P35969 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Flt1P35969 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt1P35969 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Flt1P35969 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Flt1P35969 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Flt1P35969 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt1P35969 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flt1P35969 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Flt1P35969 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Flt1P35969 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Flt1P35969 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Flt1P35969 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Flt1P35969 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Flt1P35969 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Flt1P35969 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Flt1P35969 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Flt1P35969 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms