Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfc1P35601 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc1P35601 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc1P35601 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc1P35601 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfc1P35601 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.8 ms