Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cnga1P29974 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cnga1P29974 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cnga1P29974 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cnga1P29974 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cnga1P29974 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cnga1P29974 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cnga1P29974 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cnga1P29974 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cnga1P29974 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cnga1P29974 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Cnga1P29974 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cnga1P29974 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Cnga1P29974 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cnga1P29974 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms