Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Epha3P29319 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Epha3P29319 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epha3P29319 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Epha3P29319 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Epha3P29319 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Epha3P29319 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Epha3P29319 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Epha3P29319 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Epha3P29319 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Epha3P29319 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Epha3P29319 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Epha3P29319 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Epha3P29319 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Epha3P29319 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Epha3P29319 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Epha3P29319 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Epha3P29319 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.4 ms