Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkcdP28867 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkcdP28867 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcdP28867 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkcdP28867 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcdP28867 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms