Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kif3aP28741 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kif3aP28741 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kif3aP28741 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kif3aP28741 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms