Protein–RNA interactions for Protein: P28334

Htr1b, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1bP28334 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr1bP28334 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr1bP28334 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htr1bP28334 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr1bP28334 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr1bP28334 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr1bP28334 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Htr1bP28334 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Htr1bP28334 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr1bP28334 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr1bP28334 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Htr1bP28334 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr1bP28334 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr1bP28334 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr1bP28334 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Htr1bP28334 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr1bP28334 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr1bP28334 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr1bP28334 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1bP28334 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1bP28334 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1bP28334 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1bP28334 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1bP28334 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr1bP28334 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Htr1bP28334 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Htr1bP28334 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr1bP28334 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr1bP28334 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr1bP28334 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms