Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Etv4P28322 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Etv4P28322 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Etv4P28322 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Etv4P28322 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Etv4P28322 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Etv4P28322 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Etv4P28322 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Etv4P28322 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Etv4P28322 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Etv4P28322 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Etv4P28322 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Etv4P28322 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Etv4P28322 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Etv4P28322 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Etv4P28322 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv4P28322 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Etv4P28322 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms