Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb3P28231 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb3P28231 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb3P28231 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb3P28231 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjb3P28231 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb3P28231 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb3P28231 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb3P28231 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb3P28231 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb3P28231 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb3P28231 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms