Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb1P28230 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb1P28230 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb1P28230 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjb1P28230 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb1P28230 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb1P28230 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms