Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af2P26369 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af2P26369 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2af2P26369 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af2P26369 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af2P26369 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af2P26369 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2af2P26369 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
U2af2P26369 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2af2P26369 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af2P26369 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af2P26369 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af2P26369 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af2P26369 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
U2af2P26369 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af2P26369 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2af2P26369 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af2P26369 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af2P26369 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
U2af2P26369 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af2P26369 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms