Protein–RNA interactions for Protein: P25918

Cd19, B-lymphocyte antigen CD19, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd19P25918 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd19P25918 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd19P25918 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd19P25918 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd19P25918 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd19P25918 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd19P25918 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd19P25918 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd19P25918 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd19P25918 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd19P25918 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd19P25918 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd19P25918 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd19P25918 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd19P25918 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd19P25918 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd19P25918 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd19P25918 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd19P25918 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms